Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 VPS53-202ENST00000389040 1903 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.84e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 VPS53-203ENST00000401468 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.894e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 YWHAE-203ENST00000469398 676 ntTSL 29.48□□□□□ -0.894e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 VPS53-219ENST00000576019 613 ntTSL 35.8□□□□□ -1.484e-9■■■■■ 30.8
GRSF1Q12849 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 30.7
GRSF1Q12849 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 30.7
GRSF1Q12849 GNA11-203ENST00000586763 354 ntTSL 316.82■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 30.7
GRSF1Q12849 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 30.5
GRSF1Q12849 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 30.5
GRSF1Q12849 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.943e-8■■■■■ 30.2
GRSF1Q12849 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.93□□□□□ -1.786e-12■■■■■ 30.2
GRSF1Q12849 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -11e-7■■■■■ 30.1
GRSF1Q12849 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 29.9
GRSF1Q12849 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.978e-9■■■■■ 29.9
GRSF1Q12849 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.418e-9■■■■■ 29.9
GRSF1Q12849 RBM38-202ENST00000344785 2193 ntTSL 517.57■□□□□ 0.48e-9■■■■■ 29.9
GRSF1Q12849 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.068e-9■■■■■ 29.9
GRSF1Q12849 GNAI2-210ENST00000490122 2445 ntTSL 213.55□□□□□ -0.248e-9■■■■■ 29.9
GRSF1Q12849 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 29.7
GRSF1Q12849 ELL-202ENST00000594635 4074 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 29.7
GRSF1Q12849 ERMP1-201ENST00000214893 4974 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.855e-16■■■■■ 29.6
GRSF1Q12849 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 29.3
GRSF1Q12849 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 29.3
GRSF1Q12849 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 29.3
GRSF1Q12849 KIAA0753-205ENST00000571642 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 45.83□□□□□ -1.485e-7■■■■■ 29.3
GRSF1Q12849 KIAA0753-203ENST00000570455 447 ntTSL 53.9□□□□□ -1.795e-7■■■■■ 29.3
GRSF1Q12849 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 29.2
GRSF1Q12849 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.317e-45■■■■■ 29.2
GRSF1Q12849 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.827e-45■■■■■ 29.2
GRSF1Q12849 ZGPAT-205ENST00000431125 427 ntTSL 220■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 29.1
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GRSF1Q12849 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.344e-10■■■■■ 28.9
GRSF1Q12849 MRPL19-202ENST00000393909 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.924e-10■■■■■ 28.9
GRSF1Q12849 MRPL19-204ENST00000453233 475 ntTSL 34.87□□□□□ -1.634e-10■■■■■ 28.9
GRSF1Q12849 MRPL19-206ENST00000492255 359 ntTSL 34.67□□□□□ -1.664e-10■■■■■ 28.9
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GRSF1Q12849 ALDH4A1-204ENST00000454547 485 ntTSL 212.71□□□□□ -0.375e-8■■■■■ 28.8
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GRSF1Q12849 PASK-214ENST00000493544 5174 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 28.7
GRSF1Q12849 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 28.7
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GRSF1Q12849 PASK-202ENST00000358649 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 28.7
GRSF1Q12849 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 28.7
GRSF1Q12849 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 28.6
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GRSF1Q12849 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.293e-8■■■■■ 28.2
GRSF1Q12849 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.223e-8■■■■■ 28.2
GRSF1Q12849 CREBL2-202ENST00000540224 667 ntTSL 521.87■■□□□ 1.093e-8■■■■■ 28.2
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GRSF1Q12849 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 28.2
GRSF1Q12849 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 28.2
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GRSF1Q12849 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 28.2
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GRSF1Q12849 ERICH1-209ENST00000523415 3630 ntTSL 27.96□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 28.2
GRSF1Q12849 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.213e-8■■■■■ 28.2
GRSF1Q12849 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.111e-10■■■■■ 28.2
GRSF1Q12849 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 28
GRSF1Q12849 UBE2Q1-207ENST00000497453 830 ntTSL 518.66■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 28
GRSF1Q12849 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-9■■■■■ 28
GRSF1Q12849 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.321e-9■■■■■ 28
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GRSF1Q12849 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 28
GRSF1Q12849 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.921e-9■■■■■ 28
GRSF1Q12849 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.251e-9■■■■■ 28
GRSF1Q12849 ROBO1-211ENST00000498428 3566 ntTSL 27.13□□□□□ -1.271e-9■■■■■ 28
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GRSF1Q12849 COL9A3-203ENST00000462700 1237 ntTSL 319.77■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 COL9A3-205ENST00000466192 2194 ntTSL 217.63■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 COL9A3-208ENST00000469802 680 ntTSL 217.34■□□□□ 0.373e-8■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 NFKB2-202ENST00000336486 851 ntTSL 322.05■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 NFKB2-205ENST00000467116 1634 ntTSL 220.8■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 OPA1-214ENST00000482865 567 ntTSL 43.75□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 27.8
GRSF1Q12849 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.522e-10■■■■■ 27.7
GRSF1Q12849 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 27.7
GRSF1Q12849 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.57e-9■■■■■ 27.7
GRSF1Q12849 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.57e-9■■■■■ 27.7
GRSF1Q12849 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.487e-9■■■■■ 27.7
GRSF1Q12849 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 27.6
GRSF1Q12849 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 27.6
GRSF1Q12849 LEMD2-202ENST00000421671 2323 ntTSL 321.55■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 27.5
GRSF1Q12849 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 27.5
GRSF1Q12849 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 27.5
GRSF1Q12849 LEMD2-206ENST00000506578 1684 ntTSL 517.98■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 27.5
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