Protein–RNA interactions for Protein: Q12837

POU4F2, POU domain, class 4, transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F2Q12837 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POU4F2Q12837 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POU4F2Q12837 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POU4F2Q12837 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POU4F2Q12837 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F2Q12837 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU4F2Q12837 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU4F2Q12837 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms