Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A11Q08AI6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A11Q08AI6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A11Q08AI6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A11Q08AI6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC38A11Q08AI6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC38A11Q08AI6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC38A11Q08AI6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC38A11Q08AI6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A11Q08AI6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC38A11Q08AI6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A11Q08AI6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A11Q08AI6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms