Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PSME1Q06323 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PSME1Q06323 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PSME1Q06323 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PSME1Q06323 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PSME1Q06323 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PSME1Q06323 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PSME1Q06323 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PSME1Q06323 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PSME1Q06323 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PSME1Q06323 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PSME1Q06323 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PSME1Q06323 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PSME1Q06323 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PSME1Q06323 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PSME1Q06323 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PSME1Q06323 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PSME1Q06323 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PSME1Q06323 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PSME1Q06323 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PSME1Q06323 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PSME1Q06323 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PSME1Q06323 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PSME1Q06323 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
PSME1Q06323 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PSME1Q06323 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PSME1Q06323 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PSME1Q06323 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PSME1Q06323 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PSME1Q06323 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PSME1Q06323 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PSME1Q06323 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PSME1Q06323 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PSME1Q06323 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PSME1Q06323 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PSME1Q06323 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PSME1Q06323 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PSME1Q06323 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PSME1Q06323 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PSME1Q06323 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PSME1Q06323 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PSME1Q06323 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PSME1Q06323 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PSME1Q06323 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PSME1Q06323 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PSME1Q06323 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PSME1Q06323 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PSME1Q06323 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PSME1Q06323 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PSME1Q06323 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PSME1Q06323 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PSME1Q06323 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PSME1Q06323 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PSME1Q06323 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PSME1Q06323 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PSME1Q06323 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PSME1Q06323 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PSME1Q06323 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PSME1Q06323 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PSME1Q06323 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PSME1Q06323 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PSME1Q06323 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PSME1Q06323 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PSME1Q06323 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PSME1Q06323 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PSME1Q06323 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PSME1Q06323 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PSME1Q06323 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PSME1Q06323 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PSME1Q06323 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PSME1Q06323 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PSME1Q06323 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PSME1Q06323 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PSME1Q06323 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PSME1Q06323 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
PSME1Q06323 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms