Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCDQ05655 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCDQ05655 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCDQ05655 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCDQ05655 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCDQ05655 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCDQ05655 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCDQ05655 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCDQ05655 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCDQ05655 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCDQ05655 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCDQ05655 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCDQ05655 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKCDQ05655 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKCDQ05655 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCDQ05655 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCDQ05655 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKCDQ05655 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKCDQ05655 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKCDQ05655 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCDQ05655 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCDQ05655 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKCDQ05655 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCDQ05655 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKCDQ05655 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCDQ05655 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKCDQ05655 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKCDQ05655 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCDQ05655 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms