Protein–RNA interactions for Protein: Q03164

KMT2A, Histone-lysine N-methyltransferase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 3,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KMT2AQ03164 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KMT2AQ03164 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KMT2AQ03164 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KMT2AQ03164 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KMT2AQ03164 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KMT2AQ03164 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KMT2AQ03164 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KMT2AQ03164 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KMT2AQ03164 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KMT2AQ03164 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KMT2AQ03164 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KMT2AQ03164 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KMT2AQ03164 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KMT2AQ03164 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KMT2AQ03164 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KMT2AQ03164 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms