Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OC90Q02509 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
OC90Q02509 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OC90Q02509 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OC90Q02509 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OC90Q02509 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OC90Q02509 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OC90Q02509 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OC90Q02509 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OC90Q02509 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OC90Q02509 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OC90Q02509 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OC90Q02509 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OC90Q02509 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OC90Q02509 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
OC90Q02509 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OC90Q02509 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
OC90Q02509 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OC90Q02509 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OC90Q02509 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OC90Q02509 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OC90Q02509 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OC90Q02509 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OC90Q02509 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OC90Q02509 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OC90Q02509 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25■■□□□ 1.59
OC90Q02509 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OC90Q02509 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OC90Q02509 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OC90Q02509 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OC90Q02509 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OC90Q02509 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OC90Q02509 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OC90Q02509 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
OC90Q02509 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OC90Q02509 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OC90Q02509 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OC90Q02509 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OC90Q02509 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OC90Q02509 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OC90Q02509 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OC90Q02509 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OC90Q02509 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OC90Q02509 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OC90Q02509 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OC90Q02509 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OC90Q02509 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OC90Q02509 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OC90Q02509 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OC90Q02509 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OC90Q02509 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OC90Q02509 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OC90Q02509 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OC90Q02509 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OC90Q02509 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
OC90Q02509 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OC90Q02509 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OC90Q02509 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OC90Q02509 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OC90Q02509 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OC90Q02509 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OC90Q02509 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OC90Q02509 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
OC90Q02509 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OC90Q02509 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OC90Q02509 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OC90Q02509 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OC90Q02509 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OC90Q02509 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OC90Q02509 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OC90Q02509 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OC90Q02509 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OC90Q02509 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OC90Q02509 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OC90Q02509 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OC90Q02509 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OC90Q02509 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OC90Q02509 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OC90Q02509 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OC90Q02509 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OC90Q02509 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OC90Q02509 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OC90Q02509 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OC90Q02509 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OC90Q02509 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OC90Q02509 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OC90Q02509 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OC90Q02509 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OC90Q02509 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OC90Q02509 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OC90Q02509 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OC90Q02509 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OC90Q02509 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OC90Q02509 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OC90Q02509 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OC90Q02509 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OC90Q02509 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OC90Q02509 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OC90Q02509 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OC90Q02509 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms