Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DSC2Q02487 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSC2Q02487 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DSC2Q02487 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSC2Q02487 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSC2Q02487 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DSC2Q02487 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DSC2Q02487 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DSC2Q02487 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DSC2Q02487 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DSC2Q02487 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DSC2Q02487 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DSC2Q02487 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DSC2Q02487 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DSC2Q02487 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DSC2Q02487 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DSC2Q02487 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DSC2Q02487 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSC2Q02487 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DSC2Q02487 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DSC2Q02487 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DSC2Q02487 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSC2Q02487 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSC2Q02487 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSC2Q02487 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSC2Q02487 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSC2Q02487 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSC2Q02487 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DSC2Q02487 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSC2Q02487 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DSC2Q02487 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSC2Q02487 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSC2Q02487 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSC2Q02487 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSC2Q02487 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSC2Q02487 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSC2Q02487 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSC2Q02487 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms