Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SATB1Q01826 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SATB1Q01826 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SATB1Q01826 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SATB1Q01826 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SATB1Q01826 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SATB1Q01826 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SATB1Q01826 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SATB1Q01826 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SATB1Q01826 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SATB1Q01826 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SATB1Q01826 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SATB1Q01826 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SATB1Q01826 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SATB1Q01826 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SATB1Q01826 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SATB1Q01826 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SATB1Q01826 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SATB1Q01826 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SATB1Q01826 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SATB1Q01826 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SATB1Q01826 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SATB1Q01826 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SATB1Q01826 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SATB1Q01826 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SATB1Q01826 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SATB1Q01826 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SATB1Q01826 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SATB1Q01826 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SATB1Q01826 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SATB1Q01826 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SATB1Q01826 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms