Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FGD1P98174 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FGD1P98174 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FGD1P98174 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FGD1P98174 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FGD1P98174 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FGD1P98174 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD1P98174 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FGD1P98174 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGD1P98174 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGD1P98174 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FGD1P98174 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FGD1P98174 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FGD1P98174 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FGD1P98174 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FGD1P98174 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD1P98174 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD1P98174 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD1P98174 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FGD1P98174 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FGD1P98174 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FGD1P98174 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FGD1P98174 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FGD1P98174 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FGD1P98174 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FGD1P98174 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FGD1P98174 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FGD1P98174 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FGD1P98174 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
FGD1P98174 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FGD1P98174 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FGD1P98174 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FGD1P98174 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FGD1P98174 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
FGD1P98174 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FGD1P98174 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FGD1P98174 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FGD1P98174 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
FGD1P98174 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FGD1P98174 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
FGD1P98174 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FGD1P98174 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FGD1P98174 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FGD1P98174 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FGD1P98174 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FGD1P98174 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FGD1P98174 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FGD1P98174 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FGD1P98174 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
FGD1P98174 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FGD1P98174 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FGD1P98174 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FGD1P98174 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FGD1P98174 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
FGD1P98174 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
FGD1P98174 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FGD1P98174 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FGD1P98174 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FGD1P98174 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FGD1P98174 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FGD1P98174 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FGD1P98174 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FGD1P98174 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FGD1P98174 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FGD1P98174 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FGD1P98174 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FGD1P98174 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FGD1P98174 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FGD1P98174 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FGD1P98174 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FGD1P98174 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FGD1P98174 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
FGD1P98174 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FGD1P98174 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FGD1P98174 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FGD1P98174 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FGD1P98174 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FGD1P98174 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FGD1P98174 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FGD1P98174 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
FGD1P98174 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD1P98174 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD1P98174 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FGD1P98174 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FGD1P98174 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FGD1P98174 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD1P98174 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FGD1P98174 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FGD1P98174 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD1P98174 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FGD1P98174 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FGD1P98174 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FGD1P98174 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
FGD1P98174 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FGD1P98174 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FGD1P98174 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
FGD1P98174 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FGD1P98174 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
FGD1P98174 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FGD1P98174 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms