Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PKD1P98161 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PKD1P98161 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PKD1P98161 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKD1P98161 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PKD1P98161 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PKD1P98161 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PKD1P98161 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKD1P98161 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKD1P98161 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PKD1P98161 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKD1P98161 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PKD1P98161 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKD1P98161 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKD1P98161 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PKD1P98161 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKD1P98161 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKD1P98161 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PKD1P98161 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKD1P98161 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKD1P98161 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKD1P98161 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKD1P98161 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKD1P98161 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKD1P98161 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKD1P98161 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKD1P98161 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKD1P98161 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKD1P98161 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKD1P98161 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKD1P98161 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKD1P98161 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKD1P98161 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKD1P98161 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKD1P98161 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKD1P98161 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PKD1P98161 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKD1P98161 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PKD1P98161 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PKD1P98161 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKD1P98161 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKD1P98161 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKD1P98161 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKD1P98161 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKD1P98161 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKD1P98161 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKD1P98161 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKD1P98161 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKD1P98161 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKD1P98161 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKD1P98161 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKD1P98161 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKD1P98161 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKD1P98161 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PKD1P98161 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKD1P98161 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKD1P98161 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PKD1P98161 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PKD1P98161 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PKD1P98161 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKD1P98161 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PKD1P98161 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKD1P98161 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKD1P98161 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKD1P98161 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKD1P98161 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKD1P98161 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKD1P98161 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKD1P98161 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKD1P98161 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKD1P98161 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKD1P98161 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKD1P98161 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKD1P98161 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKD1P98161 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKD1P98161 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKD1P98161 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKD1P98161 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKD1P98161 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKD1P98161 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKD1P98161 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKD1P98161 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKD1P98161 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKD1P98161 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKD1P98161 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKD1P98161 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKD1P98161 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKD1P98161 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKD1P98161 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKD1P98161 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKD1P98161 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKD1P98161 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PKD1P98161 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PKD1P98161 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKD1P98161 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKD1P98161 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PKD1P98161 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PKD1P98161 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKD1P98161 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PKD1P98161 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms