Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3F3AP84243 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3F3AP84243 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3F3AP84243 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3F3AP84243 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H3F3AP84243 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3F3AP84243 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms