Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MRPS25P82663 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MRPS25P82663 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPS25P82663 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPS25P82663 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPS25P82663 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPS25P82663 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MRPS25P82663 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MRPS25P82663 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MRPS25P82663 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MRPS25P82663 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MRPS25P82663 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MRPS25P82663 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MRPS25P82663 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MRPS25P82663 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPS25P82663 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MRPS25P82663 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MRPS25P82663 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPS25P82663 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPS25P82663 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPS25P82663 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPS25P82663 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPS25P82663 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPS25P82663 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPS25P82663 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPS25P82663 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPS25P82663 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MRPS25P82663 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MRPS25P82663 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MRPS25P82663 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MRPS25P82663 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms