Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
IRX6P78412 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
IRX6P78412 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IRX6P78412 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IRX6P78412 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IRX6P78412 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
IRX6P78412 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
IRX6P78412 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
IRX6P78412 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
IRX6P78412 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
IRX6P78412 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
IRX6P78412 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
IRX6P78412 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
IRX6P78412 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
IRX6P78412 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
IRX6P78412 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
IRX6P78412 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
IRX6P78412 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
IRX6P78412 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IRX6P78412 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
IRX6P78412 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
IRX6P78412 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IRX6P78412 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
IRX6P78412 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
IRX6P78412 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IRX6P78412 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
IRX6P78412 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
IRX6P78412 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IRX6P78412 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
IRX6P78412 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
IRX6P78412 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
IRX6P78412 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
IRX6P78412 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
IRX6P78412 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
IRX6P78412 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
IRX6P78412 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
IRX6P78412 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
IRX6P78412 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
IRX6P78412 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
IRX6P78412 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
IRX6P78412 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
IRX6P78412 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
IRX6P78412 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
IRX6P78412 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
IRX6P78412 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
IRX6P78412 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
IRX6P78412 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
IRX6P78412 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
IRX6P78412 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
IRX6P78412 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
IRX6P78412 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
IRX6P78412 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IRX6P78412 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IRX6P78412 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IRX6P78412 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IRX6P78412 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
IRX6P78412 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
IRX6P78412 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
IRX6P78412 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
IRX6P78412 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
IRX6P78412 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
IRX6P78412 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
IRX6P78412 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
IRX6P78412 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
IRX6P78412 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
IRX6P78412 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
IRX6P78412 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IRX6P78412 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
IRX6P78412 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IRX6P78412 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IRX6P78412 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IRX6P78412 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IRX6P78412 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IRX6P78412 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IRX6P78412 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IRX6P78412 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
IRX6P78412 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
IRX6P78412 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IRX6P78412 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IRX6P78412 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IRX6P78412 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
IRX6P78412 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IRX6P78412 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IRX6P78412 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
IRX6P78412 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
IRX6P78412 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
IRX6P78412 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IRX6P78412 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IRX6P78412 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IRX6P78412 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
IRX6P78412 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IRX6P78412 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IRX6P78412 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IRX6P78412 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
IRX6P78412 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
IRX6P78412 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IRX6P78412 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
IRX6P78412 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
IRX6P78412 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
IRX6P78412 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms