Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNG7P62955 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNG7P62955 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNG7P62955 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNG7P62955 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CACNG7P62955 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CACNG7P62955 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNG7P62955 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms