Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TGFB2P61812 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TGFB2P61812 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TGFB2P61812 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TGFB2P61812 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TGFB2P61812 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TGFB2P61812 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TGFB2P61812 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TGFB2P61812 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TGFB2P61812 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TGFB2P61812 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TGFB2P61812 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TGFB2P61812 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TGFB2P61812 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TGFB2P61812 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TGFB2P61812 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TGFB2P61812 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TGFB2P61812 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TGFB2P61812 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TGFB2P61812 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TGFB2P61812 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TGFB2P61812 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TGFB2P61812 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TGFB2P61812 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TGFB2P61812 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TGFB2P61812 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TGFB2P61812 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TGFB2P61812 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TGFB2P61812 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TGFB2P61812 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TGFB2P61812 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TGFB2P61812 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TGFB2P61812 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TGFB2P61812 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TGFB2P61812 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TGFB2P61812 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TGFB2P61812 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TGFB2P61812 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TGFB2P61812 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
TGFB2P61812 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TGFB2P61812 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TGFB2P61812 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TGFB2P61812 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TGFB2P61812 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms