Protein–RNA interactions for Protein: P61086

UBE2K, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2KP61086 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2KP61086 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2KP61086 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2KP61086 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2KP61086 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBE2KP61086 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2KP61086 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2KP61086 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms