Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC42P60953 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42P60953 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42P60953 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42P60953 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42P60953 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42P60953 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC42P60953 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42P60953 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC42P60953 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42P60953 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42P60953 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC42P60953 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC42P60953 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42P60953 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDC42P60953 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42P60953 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42P60953 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDC42P60953 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDC42P60953 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDC42P60953 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDC42P60953 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDC42P60953 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42P60953 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDC42P60953 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42P60953 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42P60953 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42P60953 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC42P60953 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42P60953 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42P60953 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42P60953 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42P60953 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42P60953 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42P60953 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42P60953 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42P60953 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42P60953 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42P60953 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42P60953 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42P60953 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42P60953 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42P60953 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC42P60953 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC42P60953 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC42P60953 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC42P60953 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42P60953 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42P60953 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC42P60953 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42P60953 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42P60953 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC42P60953 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42P60953 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42P60953 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42P60953 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDC42P60953 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDC42P60953 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42P60953 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC42P60953 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42P60953 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42P60953 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC42P60953 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42P60953 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42P60953 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC42P60953 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC42P60953 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC42P60953 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC42P60953 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42P60953 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42P60953 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC42P60953 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42P60953 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42P60953 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC42P60953 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDC42P60953 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42P60953 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDC42P60953 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDC42P60953 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42P60953 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDC42P60953 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42P60953 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42P60953 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42P60953 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDC42P60953 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42P60953 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDC42P60953 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42P60953 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42P60953 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42P60953 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42P60953 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDC42P60953 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDC42P60953 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42P60953 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42P60953 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42P60953 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42P60953 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42P60953 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42P60953 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42P60953 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms