Protein–RNA interactions for Protein: P58417

NXPH1, Neurexophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH1P58417 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NXPH1P58417 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NXPH1P58417 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NXPH1P58417 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NXPH1P58417 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NXPH1P58417 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXPH1P58417 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXPH1P58417 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXPH1P58417 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NXPH1P58417 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXPH1P58417 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXPH1P58417 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXPH1P58417 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NXPH1P58417 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXPH1P58417 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NXPH1P58417 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXPH1P58417 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms