Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PER3P56645 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PER3P56645 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PER3P56645 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PER3P56645 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PER3P56645 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PER3P56645 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PER3P56645 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PER3P56645 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PER3P56645 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PER3P56645 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PER3P56645 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PER3P56645 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PER3P56645 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PER3P56645 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PER3P56645 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PER3P56645 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PER3P56645 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PER3P56645 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PER3P56645 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PER3P56645 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PER3P56645 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PER3P56645 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PER3P56645 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PER3P56645 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PER3P56645 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PER3P56645 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PER3P56645 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PER3P56645 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PER3P56645 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PER3P56645 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PER3P56645 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PER3P56645 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PER3P56645 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PER3P56645 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PER3P56645 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PER3P56645 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PER3P56645 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PER3P56645 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PER3P56645 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PER3P56645 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PER3P56645 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PER3P56645 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PER3P56645 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PER3P56645 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PER3P56645 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PER3P56645 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PER3P56645 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PER3P56645 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PER3P56645 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PER3P56645 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PER3P56645 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PER3P56645 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PER3P56645 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PER3P56645 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PER3P56645 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PER3P56645 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER3P56645 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER3P56645 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER3P56645 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PER3P56645 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PER3P56645 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER3P56645 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER3P56645 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER3P56645 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER3P56645 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PER3P56645 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PER3P56645 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PER3P56645 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PER3P56645 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PER3P56645 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PER3P56645 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PER3P56645 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PER3P56645 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER3P56645 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER3P56645 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER3P56645 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER3P56645 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER3P56645 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PER3P56645 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PER3P56645 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PER3P56645 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER3P56645 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER3P56645 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER3P56645 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER3P56645 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER3P56645 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER3P56645 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER3P56645 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER3P56645 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER3P56645 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PER3P56645 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PER3P56645 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PER3P56645 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PER3P56645 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PER3P56645 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PER3P56645 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PER3P56645 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PER3P56645 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PER3P56645 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms