Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTEP56180 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPTEP56180 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTEP56180 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTEP56180 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPTEP56180 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPTEP56180 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPTEP56180 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPTEP56180 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPTEP56180 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPTEP56180 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTEP56180 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPTEP56180 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTEP56180 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPTEP56180 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTEP56180 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TPTEP56180 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTEP56180 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTEP56180 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTEP56180 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPTEP56180 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPTEP56180 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTEP56180 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPTEP56180 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTEP56180 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTEP56180 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPTEP56180 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPTEP56180 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTEP56180 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTEP56180 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTEP56180 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTEP56180 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPTEP56180 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPTEP56180 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPTEP56180 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPTEP56180 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPTEP56180 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPTEP56180 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPTEP56180 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPTEP56180 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TPTEP56180 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPTEP56180 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPTEP56180 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPTEP56180 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPTEP56180 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPTEP56180 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPTEP56180 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPTEP56180 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPTEP56180 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPTEP56180 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPTEP56180 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPTEP56180 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPTEP56180 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPTEP56180 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPTEP56180 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPTEP56180 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TPTEP56180 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPTEP56180 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPTEP56180 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPTEP56180 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPTEP56180 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPTEP56180 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPTEP56180 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPTEP56180 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPTEP56180 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPTEP56180 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPTEP56180 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TPTEP56180 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPTEP56180 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPTEP56180 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPTEP56180 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPTEP56180 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPTEP56180 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTEP56180 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPTEP56180 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTEP56180 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTEP56180 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTEP56180 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPTEP56180 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTEP56180 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPTEP56180 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTEP56180 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTEP56180 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTEP56180 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPTEP56180 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPTEP56180 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPTEP56180 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPTEP56180 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPTEP56180 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPTEP56180 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPTEP56180 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPTEP56180 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPTEP56180 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPTEP56180 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPTEP56180 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPTEP56180 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TPTEP56180 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPTEP56180 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPTEP56180 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPTEP56180 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms