Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VCPP55072 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VCPP55072 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VCPP55072 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VCPP55072 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VCPP55072 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VCPP55072 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VCPP55072 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VCPP55072 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29■■■□□ 2.23
VCPP55072 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VCPP55072 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VCPP55072 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VCPP55072 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VCPP55072 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VCPP55072 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VCPP55072 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VCPP55072 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VCPP55072 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VCPP55072 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VCPP55072 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VCPP55072 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VCPP55072 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCPP55072 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCPP55072 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCPP55072 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCPP55072 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VCPP55072 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VCPP55072 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VCPP55072 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VCPP55072 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VCPP55072 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VCPP55072 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VCPP55072 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VCPP55072 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VCPP55072 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VCPP55072 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VCPP55072 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VCPP55072 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VCPP55072 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VCPP55072 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VCPP55072 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VCPP55072 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VCPP55072 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VCPP55072 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VCPP55072 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VCPP55072 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VCPP55072 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VCPP55072 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VCPP55072 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VCPP55072 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VCPP55072 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VCPP55072 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VCPP55072 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VCPP55072 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VCPP55072 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VCPP55072 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VCPP55072 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VCPP55072 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VCPP55072 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VCPP55072 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VCPP55072 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VCPP55072 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VCPP55072 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VCPP55072 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VCPP55072 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VCPP55072 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VCPP55072 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VCPP55072 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VCPP55072 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VCPP55072 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VCPP55072 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VCPP55072 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VCPP55072 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VCPP55072 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VCPP55072 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VCPP55072 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VCPP55072 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VCPP55072 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VCPP55072 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VCPP55072 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VCPP55072 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
VCPP55072 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VCPP55072 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VCPP55072 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VCPP55072 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VCPP55072 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VCPP55072 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VCPP55072 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VCPP55072 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VCPP55072 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VCPP55072 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VCPP55072 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VCPP55072 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VCPP55072 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VCPP55072 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VCPP55072 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VCPP55072 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VCPP55072 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VCPP55072 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VCPP55072 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms