Protein–RNA interactions for Protein: P54886

ALDH18A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH18A1P54886 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH18A1P54886 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH18A1P54886 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ALDH18A1P54886 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALDH18A1P54886 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALDH18A1P54886 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ALDH18A1P54886 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH18A1P54886 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH18A1P54886 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALDH18A1P54886 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH18A1P54886 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALDH18A1P54886 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH18A1P54886 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALDH18A1P54886 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALDH18A1P54886 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH18A1P54886 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALDH18A1P54886 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ALDH18A1P54886 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH18A1P54886 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALDH18A1P54886 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALDH18A1P54886 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALDH18A1P54886 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALDH18A1P54886 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALDH18A1P54886 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALDH18A1P54886 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH18A1P54886 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH18A1P54886 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALDH18A1P54886 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH18A1P54886 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH18A1P54886 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALDH18A1P54886 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALDH18A1P54886 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALDH18A1P54886 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALDH18A1P54886 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms