Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATXN1P54253 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATXN1P54253 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATXN1P54253 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATXN1P54253 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATXN1P54253 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN1P54253 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATXN1P54253 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATXN1P54253 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATXN1P54253 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATXN1P54253 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATXN1P54253 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATXN1P54253 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATXN1P54253 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATXN1P54253 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN1P54253 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATXN1P54253 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATXN1P54253 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATXN1P54253 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms