Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLNS1AP54105 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLNS1AP54105 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLNS1AP54105 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLNS1AP54105 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLNS1AP54105 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLNS1AP54105 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLNS1AP54105 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLNS1AP54105 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLNS1AP54105 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLNS1AP54105 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLNS1AP54105 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLNS1AP54105 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLNS1AP54105 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLNS1AP54105 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLNS1AP54105 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLNS1AP54105 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLNS1AP54105 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms