Protein–RNA interactions for Protein: P53804

TTC3, E3 ubiquitin-protein ligase TTC3, humanhuman

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3P53804 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC3P53804 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC3P53804 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC3P53804 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC3P53804 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC3P53804 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TTC3P53804 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC3P53804 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC3P53804 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC3P53804 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC3P53804 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC3P53804 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC3P53804 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC3P53804 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC3P53804 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TTC3P53804 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC3P53804 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC3P53804 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC3P53804 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC3P53804 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC3P53804 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC3P53804 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC3P53804 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC3P53804 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC3P53804 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC3P53804 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC3P53804 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC3P53804 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC3P53804 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC3P53804 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC3P53804 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC3P53804 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC3P53804 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC3P53804 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC3P53804 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC3P53804 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC3P53804 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC3P53804 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC3P53804 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC3P53804 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC3P53804 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC3P53804 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC3P53804 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC3P53804 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC3P53804 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTC3P53804 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTC3P53804 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC3P53804 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC3P53804 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC3P53804 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC3P53804 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC3P53804 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC3P53804 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC3P53804 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC3P53804 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC3P53804 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC3P53804 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC3P53804 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC3P53804 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC3P53804 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC3P53804 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC3P53804 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC3P53804 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC3P53804 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC3P53804 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC3P53804 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC3P53804 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC3P53804 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC3P53804 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC3P53804 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC3P53804 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC3P53804 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC3P53804 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC3P53804 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC3P53804 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC3P53804 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC3P53804 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC3P53804 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC3P53804 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC3P53804 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC3P53804 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC3P53804 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC3P53804 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC3P53804 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC3P53804 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC3P53804 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC3P53804 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC3P53804 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC3P53804 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC3P53804 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC3P53804 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC3P53804 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC3P53804 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC3P53804 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC3P53804 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC3P53804 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC3P53804 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC3P53804 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC3P53804 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC3P53804 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms