Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA8P53708 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA8P53708 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA8P53708 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA8P53708 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA8P53708 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA8P53708 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA8P53708 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA8P53708 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA8P53708 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA8P53708 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA8P53708 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA8P53708 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA8P53708 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA8P53708 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA8P53708 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA8P53708 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA8P53708 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA8P53708 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA8P53708 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA8P53708 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA8P53708 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA8P53708 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA8P53708 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA8P53708 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA8P53708 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA8P53708 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA8P53708 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA8P53708 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA8P53708 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA8P53708 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA8P53708 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ITGA8P53708 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGA8P53708 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms