Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF138P52744 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF138P52744 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF138P52744 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF138P52744 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF138P52744 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF138P52744 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF138P52744 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF138P52744 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF138P52744 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF138P52744 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF138P52744 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF138P52744 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF138P52744 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF138P52744 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF138P52744 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms