Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KA3P51812 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA3P51812 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA3P51812 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA3P51812 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KA3P51812 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA3P51812 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA3P51812 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KA3P51812 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA3P51812 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA3P51812 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA3P51812 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA3P51812 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA3P51812 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA3P51812 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA3P51812 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA3P51812 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPS6KA3P51812 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms