Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSK3AP49840 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSK3AP49840 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSK3AP49840 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSK3AP49840 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSK3AP49840 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSK3AP49840 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSK3AP49840 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSK3AP49840 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSK3AP49840 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSK3AP49840 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSK3AP49840 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSK3AP49840 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms