Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLK3P49761 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLK3P49761 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLK3P49761 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK3P49761 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK3P49761 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK3P49761 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLK3P49761 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLK3P49761 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK3P49761 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLK3P49761 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK3P49761 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLK3P49761 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK3P49761 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK3P49761 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK3P49761 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK3P49761 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLK3P49761 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK3P49761 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLK3P49761 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLK3P49761 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK3P49761 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLK3P49761 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLK3P49761 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLK3P49761 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK3P49761 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK3P49761 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK3P49761 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK3P49761 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK3P49761 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK3P49761 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK3P49761 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK3P49761 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK3P49761 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK3P49761 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLK3P49761 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLK3P49761 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK3P49761 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK3P49761 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK3P49761 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK3P49761 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK3P49761 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK3P49761 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK3P49761 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK3P49761 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK3P49761 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK3P49761 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK3P49761 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK3P49761 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK3P49761 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK3P49761 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK3P49761 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLK3P49761 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK3P49761 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK3P49761 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLK3P49761 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLK3P49761 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK3P49761 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLK3P49761 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK3P49761 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLK3P49761 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK3P49761 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLK3P49761 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK3P49761 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLK3P49761 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLK3P49761 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK3P49761 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLK3P49761 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK3P49761 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLK3P49761 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLK3P49761 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK3P49761 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK3P49761 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK3P49761 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK3P49761 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLK3P49761 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLK3P49761 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLK3P49761 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK3P49761 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK3P49761 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLK3P49761 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLK3P49761 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK3P49761 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK3P49761 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK3P49761 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK3P49761 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK3P49761 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK3P49761 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLK3P49761 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK3P49761 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK3P49761 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK3P49761 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK3P49761 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK3P49761 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK3P49761 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK3P49761 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK3P49761 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK3P49761 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK3P49761 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK3P49761 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms