Protein–RNA interactions for Protein: P49750

YLPM1, YLP motif-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YLPM1P49750 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
YLPM1P49750 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YLPM1P49750 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YLPM1P49750 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YLPM1P49750 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YLPM1P49750 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YLPM1P49750 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YLPM1P49750 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YLPM1P49750 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YLPM1P49750 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YLPM1P49750 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YLPM1P49750 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YLPM1P49750 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YLPM1P49750 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YLPM1P49750 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YLPM1P49750 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YLPM1P49750 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YLPM1P49750 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YLPM1P49750 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YLPM1P49750 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YLPM1P49750 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YLPM1P49750 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms