Protein–RNA interactions for Protein: P49207

RPL34, 60S ribosomal protein L34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL34P49207 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPL34P49207 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPL34P49207 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPL34P49207 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPL34P49207 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPL34P49207 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RPL34P49207 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPL34P49207 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPL34P49207 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPL34P49207 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPL34P49207 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPL34P49207 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPL34P49207 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPL34P49207 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RPL34P49207 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPL34P49207 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPL34P49207 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPL34P49207 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPL34P49207 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPL34P49207 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPL34P49207 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPL34P49207 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPL34P49207 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPL34P49207 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPL34P49207 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPL34P49207 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPL34P49207 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPL34P49207 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPL34P49207 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RPL34P49207 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPL34P49207 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPL34P49207 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPL34P49207 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPL34P49207 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPL34P49207 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPL34P49207 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPL34P49207 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPL34P49207 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPL34P49207 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPL34P49207 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPL34P49207 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPL34P49207 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPL34P49207 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPL34P49207 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPL34P49207 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPL34P49207 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPL34P49207 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPL34P49207 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPL34P49207 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPL34P49207 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPL34P49207 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPL34P49207 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPL34P49207 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPL34P49207 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPL34P49207 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPL34P49207 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPL34P49207 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPL34P49207 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPL34P49207 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPL34P49207 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPL34P49207 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL34P49207 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL34P49207 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPL34P49207 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPL34P49207 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPL34P49207 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPL34P49207 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPL34P49207 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPL34P49207 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPL34P49207 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPL34P49207 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPL34P49207 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPL34P49207 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPL34P49207 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPL34P49207 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPL34P49207 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPL34P49207 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPL34P49207 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPL34P49207 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPL34P49207 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPL34P49207 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPL34P49207 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPL34P49207 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPL34P49207 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPL34P49207 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPL34P49207 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPL34P49207 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPL34P49207 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPL34P49207 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPL34P49207 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPL34P49207 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms