Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GJA8P48165 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJA8P48165 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJA8P48165 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GJA8P48165 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJA8P48165 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GJA8P48165 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GJA8P48165 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GJA8P48165 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GJA8P48165 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJA8P48165 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJA8P48165 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GJA8P48165 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GJA8P48165 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJA8P48165 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GJA8P48165 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GJA8P48165 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GJA8P48165 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GJA8P48165 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GJA8P48165 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GJA8P48165 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GJA8P48165 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GJA8P48165 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GJA8P48165 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GJA8P48165 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GJA8P48165 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GJA8P48165 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GJA8P48165 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
GJA8P48165 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
GJA8P48165 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GJA8P48165 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GJA8P48165 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJA8P48165 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJA8P48165 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GJA8P48165 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJA8P48165 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GJA8P48165 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJA8P48165 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GJA8P48165 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GJA8P48165 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GJA8P48165 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJA8P48165 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GJA8P48165 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GJA8P48165 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GJA8P48165 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GJA8P48165 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GJA8P48165 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GJA8P48165 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GJA8P48165 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GJA8P48165 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GJA8P48165 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJA8P48165 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GJA8P48165 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJA8P48165 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GJA8P48165 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJA8P48165 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
GJA8P48165 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GJA8P48165 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJA8P48165 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJA8P48165 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GJA8P48165 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GJA8P48165 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
GJA8P48165 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GJA8P48165 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GJA8P48165 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GJA8P48165 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GJA8P48165 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GJA8P48165 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GJA8P48165 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJA8P48165 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GJA8P48165 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJA8P48165 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJA8P48165 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GJA8P48165 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJA8P48165 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GJA8P48165 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
GJA8P48165 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GJA8P48165 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJA8P48165 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJA8P48165 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJA8P48165 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GJA8P48165 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GJA8P48165 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GJA8P48165 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GJA8P48165 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GJA8P48165 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GJA8P48165 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GJA8P48165 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
GJA8P48165 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GJA8P48165 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GJA8P48165 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GJA8P48165 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GJA8P48165 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GJA8P48165 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJA8P48165 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GJA8P48165 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
GJA8P48165 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GJA8P48165 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GJA8P48165 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GJA8P48165 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms