Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A8P48029 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A8P48029 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A8P48029 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A8P48029 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A8P48029 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A8P48029 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A8P48029 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC6A8P48029 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A8P48029 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A8P48029 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A8P48029 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A8P48029 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A8P48029 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A8P48029 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms