Protein–RNA interactions for Protein: P46721

SLCO1A2, Solute carrier organic anion transporter family member 1A2, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1A2P46721 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLCO1A2P46721 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLCO1A2P46721 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLCO1A2P46721 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLCO1A2P46721 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLCO1A2P46721 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLCO1A2P46721 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLCO1A2P46721 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLCO1A2P46721 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLCO1A2P46721 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLCO1A2P46721 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLCO1A2P46721 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLCO1A2P46721 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLCO1A2P46721 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLCO1A2P46721 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLCO1A2P46721 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLCO1A2P46721 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLCO1A2P46721 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLCO1A2P46721 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLCO1A2P46721 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLCO1A2P46721 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLCO1A2P46721 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLCO1A2P46721 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLCO1A2P46721 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLCO1A2P46721 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLCO1A2P46721 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLCO1A2P46721 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLCO1A2P46721 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms