Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOP2P46087 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOP2P46087 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOP2P46087 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP2P46087 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP2P46087 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOP2P46087 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP2P46087 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOP2P46087 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP2P46087 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOP2P46087 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOP2P46087 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP2P46087 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOP2P46087 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOP2P46087 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOP2P46087 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOP2P46087 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOP2P46087 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOP2P46087 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOP2P46087 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP2P46087 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP2P46087 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOP2P46087 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP2P46087 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP2P46087 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP2P46087 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP2P46087 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP2P46087 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP2P46087 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP2P46087 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP2P46087 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP2P46087 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP2P46087 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP2P46087 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP2P46087 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP2P46087 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP2P46087 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP2P46087 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP2P46087 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOP2P46087 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP2P46087 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP2P46087 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP2P46087 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOP2P46087 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOP2P46087 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOP2P46087 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP2P46087 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOP2P46087 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP2P46087 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NOP2P46087 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP2P46087 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP2P46087 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP2P46087 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOP2P46087 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP2P46087 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP2P46087 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOP2P46087 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP2P46087 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOP2P46087 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NOP2P46087 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP2P46087 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP2P46087 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NOP2P46087 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP2P46087 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP2P46087 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP2P46087 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOP2P46087 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP2P46087 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP2P46087 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP2P46087 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP2P46087 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP2P46087 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP2P46087 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP2P46087 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP2P46087 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP2P46087 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP2P46087 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP2P46087 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP2P46087 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP2P46087 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP2P46087 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP2P46087 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP2P46087 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP2P46087 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOP2P46087 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOP2P46087 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP2P46087 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOP2P46087 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOP2P46087 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOP2P46087 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOP2P46087 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms