Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX5P45973 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX5P45973 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX5P45973 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX5P45973 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX5P45973 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CBX5P45973 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CBX5P45973 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX5P45973 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX5P45973 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX5P45973 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX5P45973 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX5P45973 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX5P45973 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX5P45973 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX5P45973 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX5P45973 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX5P45973 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX5P45973 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX5P45973 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX5P45973 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX5P45973 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX5P45973 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX5P45973 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX5P45973 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX5P45973 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX5P45973 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX5P45973 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX5P45973 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX5P45973 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX5P45973 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX5P45973 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX5P45973 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX5P45973 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX5P45973 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX5P45973 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX5P45973 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX5P45973 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX5P45973 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX5P45973 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX5P45973 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX5P45973 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX5P45973 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX5P45973 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX5P45973 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX5P45973 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX5P45973 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX5P45973 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX5P45973 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX5P45973 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX5P45973 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX5P45973 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX5P45973 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX5P45973 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX5P45973 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX5P45973 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX5P45973 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX5P45973 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX5P45973 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX5P45973 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX5P45973 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX5P45973 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX5P45973 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX5P45973 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX5P45973 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX5P45973 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX5P45973 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX5P45973 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX5P45973 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX5P45973 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX5P45973 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX5P45973 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX5P45973 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX5P45973 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX5P45973 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX5P45973 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX5P45973 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX5P45973 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX5P45973 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX5P45973 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX5P45973 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX5P45973 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX5P45973 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX5P45973 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX5P45973 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX5P45973 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX5P45973 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX5P45973 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX5P45973 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX5P45973 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX5P45973 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX5P45973 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX5P45973 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX5P45973 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX5P45973 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX5P45973 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX5P45973 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX5P45973 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX5P45973 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX5P45973 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms