Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR4A2P43354 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR4A2P43354 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR4A2P43354 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NR4A2P43354 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR4A2P43354 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR4A2P43354 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms