Protein–RNA interactions for Protein: P42694

HELZ, Probable helicase with zinc finger domain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELZP42694 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELZP42694 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELZP42694 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELZP42694 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELZP42694 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELZP42694 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELZP42694 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELZP42694 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELZP42694 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELZP42694 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HELZP42694 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HELZP42694 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HELZP42694 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HELZP42694 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HELZP42694 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HELZP42694 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HELZP42694 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HELZP42694 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HELZP42694 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELZP42694 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HELZP42694 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELZP42694 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELZP42694 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HELZP42694 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELZP42694 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HELZP42694 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELZP42694 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HELZP42694 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELZP42694 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELZP42694 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HELZP42694 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HELZP42694 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HELZP42694 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELZP42694 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HELZP42694 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELZP42694 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELZP42694 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HELZP42694 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELZP42694 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELZP42694 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELZP42694 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELZP42694 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELZP42694 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELZP42694 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELZP42694 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELZP42694 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELZP42694 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELZP42694 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELZP42694 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HELZP42694 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELZP42694 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELZP42694 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELZP42694 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELZP42694 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELZP42694 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELZP42694 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELZP42694 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELZP42694 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELZP42694 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELZP42694 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELZP42694 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HELZP42694 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HELZP42694 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HELZP42694 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELZP42694 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HELZP42694 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELZP42694 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELZP42694 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELZP42694 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HELZP42694 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELZP42694 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELZP42694 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELZP42694 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELZP42694 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HELZP42694 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HELZP42694 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HELZP42694 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HELZP42694 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELZP42694 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELZP42694 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELZP42694 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELZP42694 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HELZP42694 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELZP42694 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELZP42694 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELZP42694 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HELZP42694 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELZP42694 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HELZP42694 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELZP42694 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELZP42694 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELZP42694 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELZP42694 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HELZP42694 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELZP42694 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HELZP42694 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELZP42694 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELZP42694 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HELZP42694 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HELZP42694 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms