Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PI4KAP42356 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PI4KAP42356 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PI4KAP42356 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PI4KAP42356 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PI4KAP42356 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PI4KAP42356 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PI4KAP42356 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PI4KAP42356 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PI4KAP42356 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PI4KAP42356 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PI4KAP42356 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PI4KAP42356 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PI4KAP42356 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PI4KAP42356 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PI4KAP42356 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PI4KAP42356 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PI4KAP42356 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PI4KAP42356 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PI4KAP42356 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4KAP42356 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4KAP42356 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PI4KAP42356 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PI4KAP42356 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PI4KAP42356 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PI4KAP42356 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PI4KAP42356 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PI4KAP42356 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PI4KAP42356 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PI4KAP42356 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PI4KAP42356 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PI4KAP42356 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms