Protein–RNA interactions for Protein: P40967

PMEL, Melanocyte protein PMEL, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMELP40967 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PMELP40967 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMELP40967 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMELP40967 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PMELP40967 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PMELP40967 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMELP40967 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMELP40967 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PMELP40967 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMELP40967 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMELP40967 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMELP40967 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMELP40967 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMELP40967 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMELP40967 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMELP40967 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMELP40967 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMELP40967 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMELP40967 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMELP40967 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMELP40967 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMELP40967 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMELP40967 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PMELP40967 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMELP40967 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMELP40967 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMELP40967 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMELP40967 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMELP40967 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMELP40967 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMELP40967 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PMELP40967 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PMELP40967 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMELP40967 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PMELP40967 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PMELP40967 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMELP40967 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PMELP40967 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMELP40967 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMELP40967 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMELP40967 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMELP40967 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PMELP40967 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMELP40967 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMELP40967 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMELP40967 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMELP40967 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMELP40967 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMELP40967 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PMELP40967 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMELP40967 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMELP40967 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMELP40967 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PMELP40967 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMELP40967 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMELP40967 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMELP40967 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMELP40967 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMELP40967 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PMELP40967 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMELP40967 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PMELP40967 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PMELP40967 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PMELP40967 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMELP40967 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMELP40967 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMELP40967 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMELP40967 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMELP40967 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMELP40967 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PMELP40967 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMELP40967 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PMELP40967 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMELP40967 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMELP40967 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMELP40967 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMELP40967 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMELP40967 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMELP40967 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMELP40967 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMELP40967 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMELP40967 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMELP40967 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PMELP40967 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMELP40967 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMELP40967 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMELP40967 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMELP40967 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMELP40967 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMELP40967 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMELP40967 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMELP40967 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMELP40967 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PMELP40967 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PMELP40967 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMELP40967 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMELP40967 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMELP40967 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMELP40967 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMELP40967 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms