Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARGP37231 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPARGP37231 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPARGP37231 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARGP37231 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARGP37231 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARGP37231 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARGP37231 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARGP37231 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPARGP37231 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARGP37231 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPARGP37231 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARGP37231 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARGP37231 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARGP37231 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARGP37231 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPARGP37231 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARGP37231 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARGP37231 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARGP37231 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARGP37231 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARGP37231 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPARGP37231 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARGP37231 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARGP37231 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARGP37231 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARGP37231 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARGP37231 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARGP37231 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARGP37231 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARGP37231 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARGP37231 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPARGP37231 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPARGP37231 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARGP37231 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARGP37231 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARGP37231 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARGP37231 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARGP37231 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARGP37231 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARGP37231 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARGP37231 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARGP37231 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARGP37231 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARGP37231 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPARGP37231 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARGP37231 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARGP37231 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARGP37231 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARGP37231 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARGP37231 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARGP37231 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARGP37231 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARGP37231 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARGP37231 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARGP37231 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARGP37231 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARGP37231 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARGP37231 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARGP37231 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARGP37231 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARGP37231 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARGP37231 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARGP37231 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARGP37231 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARGP37231 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPARGP37231 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPARGP37231 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARGP37231 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PPARGP37231 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARGP37231 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPARGP37231 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARGP37231 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARGP37231 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPARGP37231 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARGP37231 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPARGP37231 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPARGP37231 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARGP37231 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPARGP37231 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARGP37231 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPARGP37231 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPARGP37231 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPARGP37231 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARGP37231 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PPARGP37231 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARGP37231 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPARGP37231 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARGP37231 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARGP37231 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPARGP37231 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARGP37231 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARGP37231 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PPARGP37231 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGP37231 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGP37231 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGP37231 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGP37231 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGP37231 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPARGP37231 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms