Protein–RNA interactions for Protein: P35613

BSG, Basigin, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSGP35613 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BSGP35613 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BSGP35613 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BSGP35613 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BSGP35613 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BSGP35613 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BSGP35613 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BSGP35613 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BSGP35613 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BSGP35613 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BSGP35613 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BSGP35613 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BSGP35613 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BSGP35613 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSGP35613 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSGP35613 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSGP35613 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSGP35613 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSGP35613 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSGP35613 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSGP35613 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BSGP35613 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BSGP35613 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSGP35613 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSGP35613 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSGP35613 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BSGP35613 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BSGP35613 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BSGP35613 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BSGP35613 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BSGP35613 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BSGP35613 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BSGP35613 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BSGP35613 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BSGP35613 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BSGP35613 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BSGP35613 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BSGP35613 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BSGP35613 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BSGP35613 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BSGP35613 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BSGP35613 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BSGP35613 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BSGP35613 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BSGP35613 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BSGP35613 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BSGP35613 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BSGP35613 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BSGP35613 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BSGP35613 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BSGP35613 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BSGP35613 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BSGP35613 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BSGP35613 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BSGP35613 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BSGP35613 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BSGP35613 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSGP35613 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BSGP35613 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BSGP35613 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BSGP35613 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSGP35613 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BSGP35613 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSGP35613 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSGP35613 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSGP35613 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSGP35613 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BSGP35613 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSGP35613 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSGP35613 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BSGP35613 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSGP35613 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSGP35613 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSGP35613 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSGP35613 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSGP35613 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSGP35613 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BSGP35613 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSGP35613 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSGP35613 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSGP35613 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BSGP35613 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSGP35613 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSGP35613 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSGP35613 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSGP35613 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSGP35613 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSGP35613 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSGP35613 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSGP35613 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BSGP35613 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms