Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXD13P35453 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HOXD13P35453 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXD13P35453 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXD13P35453 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXD13P35453 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXD13P35453 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXD13P35453 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXD13P35453 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXD13P35453 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXD13P35453 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXD13P35453 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXD13P35453 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXD13P35453 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXD13P35453 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXD13P35453 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXD13P35453 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXD13P35453 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXD13P35453 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HOXD13P35453 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXD13P35453 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXD13P35453 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXD13P35453 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD13P35453 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD13P35453 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD13P35453 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXD13P35453 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXD13P35453 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXD13P35453 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXD13P35453 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD13P35453 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD13P35453 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD13P35453 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD13P35453 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXD13P35453 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms