Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HOXD12P35452 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD12P35452 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD12P35452 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXD12P35452 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD12P35452 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD12P35452 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD12P35452 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD12P35452 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD12P35452 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD12P35452 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD12P35452 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD12P35452 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD12P35452 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD12P35452 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD12P35452 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD12P35452 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD12P35452 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD12P35452 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXD12P35452 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD12P35452 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms