Protein–RNA interactions for Protein: P35367

HRH1, Histamine H1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH1P35367 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRH1P35367 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRH1P35367 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRH1P35367 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRH1P35367 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRH1P35367 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRH1P35367 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HRH1P35367 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRH1P35367 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HRH1P35367 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HRH1P35367 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRH1P35367 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HRH1P35367 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HRH1P35367 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HRH1P35367 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRH1P35367 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRH1P35367 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HRH1P35367 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HRH1P35367 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRH1P35367 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRH1P35367 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HRH1P35367 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HRH1P35367 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HRH1P35367 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HRH1P35367 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRH1P35367 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRH1P35367 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HRH1P35367 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRH1P35367 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRH1P35367 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRH1P35367 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRH1P35367 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRH1P35367 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRH1P35367 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRH1P35367 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRH1P35367 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRH1P35367 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRH1P35367 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRH1P35367 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH1P35367 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH1P35367 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HRH1P35367 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRH1P35367 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRH1P35367 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRH1P35367 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRH1P35367 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRH1P35367 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRH1P35367 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH1P35367 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRH1P35367 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRH1P35367 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRH1P35367 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HRH1P35367 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRH1P35367 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRH1P35367 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRH1P35367 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRH1P35367 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH1P35367 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH1P35367 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRH1P35367 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRH1P35367 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HRH1P35367 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH1P35367 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH1P35367 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH1P35367 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH1P35367 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH1P35367 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRH1P35367 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRH1P35367 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRH1P35367 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRH1P35367 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRH1P35367 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRH1P35367 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRH1P35367 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRH1P35367 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRH1P35367 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRH1P35367 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRH1P35367 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRH1P35367 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRH1P35367 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRH1P35367 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HRH1P35367 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HRH1P35367 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HRH1P35367 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRH1P35367 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRH1P35367 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRH1P35367 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRH1P35367 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRH1P35367 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HRH1P35367 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRH1P35367 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRH1P35367 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRH1P35367 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HRH1P35367 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HRH1P35367 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HRH1P35367 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HRH1P35367 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRH1P35367 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRH1P35367 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HRH1P35367 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms