Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC8A1P32418 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC8A1P32418 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC8A1P32418 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC8A1P32418 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC8A1P32418 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC8A1P32418 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC8A1P32418 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC8A1P32418 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC8A1P32418 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC8A1P32418 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC8A1P32418 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A1P32418 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A1P32418 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A1P32418 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A1P32418 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC8A1P32418 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC8A1P32418 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC8A1P32418 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC8A1P32418 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC8A1P32418 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC8A1P32418 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms