Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXC12P31275 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC12P31275 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXC12P31275 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXC12P31275 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC12P31275 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC12P31275 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC12P31275 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC12P31275 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC12P31275 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC12P31275 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC12P31275 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC12P31275 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC12P31275 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC12P31275 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC12P31275 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC12P31275 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms