Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA6P31267 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA6P31267 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA6P31267 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA6P31267 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA6P31267 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA6P31267 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA6P31267 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA6P31267 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA6P31267 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA6P31267 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA6P31267 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA6P31267 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA6P31267 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA6P31267 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA6P31267 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA6P31267 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA6P31267 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA6P31267 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA6P31267 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA6P31267 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA6P31267 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA6P31267 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA6P31267 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA6P31267 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA6P31267 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HOXA6P31267 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA6P31267 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA6P31267 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HOXA6P31267 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA6P31267 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA6P31267 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA6P31267 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXA6P31267 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXA6P31267 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXA6P31267 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA6P31267 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA6P31267 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA6P31267 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA6P31267 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA6P31267 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA6P31267 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA6P31267 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA6P31267 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA6P31267 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA6P31267 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA6P31267 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA6P31267 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HOXA6P31267 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA6P31267 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA6P31267 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms